甲烷脱除催化剂在实际应用中虽然具有诸多优点，但也存在一些缺点，主要包括以下几个方面：

一、硫敏感性问题

某些甲烷脱除催化剂，特别是以镍（Ni）为活性组分的催化剂，对硫非常敏感。原料气中即使含有少量的硫，也会与甲烷竞争吸附到催化剂的活性位上，导致催化剂中毒。这种中毒在催化剂的操作温度范围内往往是不可逆的，对催化剂活性的破坏程度远大于活性比表面积下降所造成的影响。为了减轻硫中毒的影响，需要对原料气进行严格的净化处理，提高脱硫精度。此外，也可以考虑开发耐硫性更强的甲烷脱除催化剂。

二、积炭问题

在甲烷化反应过程中，催化剂表面的活性位会吸附一氧化碳（CO），并随着CO的解离生成活性较高的碳原子。如果这些碳原子未能及时与氢原子结合生成甲烷（CH4），就会在催化剂表面聚集形成积炭。积炭不仅会降低催化剂的活性，还可能堵塞催化剂的孔道，影响气体的扩散和传质。为了解决积炭问题，需要优化催化剂的配方和制备工艺，提高催化剂的抗积炭性能。同时，在反应过程中需要控制适宜的操作条件，如温度、压力、空速等，以减少积炭的生成。

三、高成本问题

甲烷脱除催化剂的制备成本相对较高，特别是对于贵金属催化剂而言，高昂的原材料价格增加了催化剂的生产成本。为了降低成本，可以通过技术创新和工艺优化来降低催化剂的生产成本。同时，也可以考虑开发非贵金属催化剂或复合催化剂等替代产品，以降低成本并提高经济效益。

四、再生与回收问题

一些甲烷脱除催化剂在使用一段时间后会出现活性下降或中毒等问题，需要进行再生处理。然而，催化剂的再生过程复杂且成本较高，且再生后的催化剂性能可能无法完全恢复到初始水平。此外，对于已经失活的催化剂如何进行有效回收和再利用也是一个需要解决的问题。为了解决这些问题，需要加强催化剂再生技术的研究和开发，提高再生效率和回收率。同时，建立完善的催化剂回收和再利用体系，实现资源的循环利用和环境保护。

五、适用范围限制

不同的甲烷脱除催化剂具有不同的适用范围和性能特点。在某些特定的应用场景下，某些催化剂可能无法满足实际需求或表现出较差的性能。因此，在选择甲烷脱除催化剂时，需要根据具体的应用场景和需求进行综合考虑。